本校の中学生・高校生たちは，単に大学の講義を聴いたり研究室を訪問するだけでなく，
研究者が授業を行うなど，先進的な理数教育に取り組んでいます。この連携をきっかけに，卒業後は国際統合睡眠医科学研究機構の研究室に所属したり，土木工学の研究室に所属したりしています。
世界のトップレベルの研究者が”先生”です！
国際統合睡眠医科学研究機構
文部科学省 世界トップレベル研究拠点プログラム 国際統合睡眠医科学研究機構（WPI-IIIS）機構長 柳沢正史 教授をはじめ，様々な研究者、協力者からのプログラム，企画、研修、講演の機会，御支援，御助言を，本校がSSH指定された2013年から受けています。
世界トップの研究機関で，研究者との関わり，先端機器の様子，ワークショップ，生徒の研究発表（英語）に対するアドバイスなど様々なプログラムを行うことができています。
主な企画、プログラム
- R4_高校１年訪問【関東研修】
- R2_高校１年訪問【オンライン関東研修】（宇土高校・ブログ）
- R1_高校１年訪問【未来体験学習】（IIIS_Facebook）（宇土高校・ブログ）
- H31_高校２年訪問【SLEEP SCIENCE CHALLENGE】（IIIS_Facebook）（宇土高校・ブログ1・2・3・4）
- H30_高校１年訪問【未来体験学習】（IIIS_Facebook）（宇土高校・ブログ1・2・3・4）
- H29_高校１年訪問【未来体験学習】（IIIS_Facebook）
- H28_高校２年訪問【SLEEP SCIENCE CHALLENGE】（IIIS_Facebook・1・2・3）
- H27_高校２年訪問【SLEEP SCIENCE CHALLENGE】（IIIS_Facebook）
- H27_高校１年訪問【未来体験学習】（IIIS_Facebook）
熊本地震_支援ボード （IIIS_Facebook）
朝日新聞デジタル（眠りの不思議、高校生ら学ぶ 眠気取れないマウスに関心）
全国イノベーションコーディネータフォーラム2016（産学官連携ジャーナル）
関東研修（未来体験学習）
平成25年度から１年SSコース選択者が最先端科学技術を活用・応用した研究や最新の科学的知見に関する研究を行っている大学及び研究機関を見学、研修する機会を設定しています。
先端分野を研究する研究者とのコミュニケーションを図る機会や研究機関の実際を知る機会を通して、課題研究や進路選択について考えを深めます。
訪問先（順不同・敬称略）毎年の取組はブログ（リンク）へ
- 筑波宇宙センター（宇土高・ブログ）
- 物質材料研究機構（宇土高・ブログ）
- 高エネルギー加速器研究機構（宇土高・ブログ）
- 建築研究所（宇土高・ブログ）
- 理化学研究所（宇土高・ブログ）
- 国際農林水産業研究センター（宇土高・ブログ）
- 筑波実験植物園（宇土高・ブログ）
- 防災科学技術研究所（宇土高・ブログ）
- 日本科学未来館（宇土高・ブログ）
県内のトップ企業の方が”先生”です！
県内先端企業訪問（未来体験学習）
平成25年度から熊本県内で科学技術を活用・応用して事業を展開する研究機関及び企業を見学、研修する機会を設定しています。高校１年生全員が、科学技術の発展の様子と日常生活との関連を理解する機会にするとともに、探究活動を進めるうえで必要な知識や素養を高める貴重な経験となっています。
訪問先（順不同・敬称略）毎年の取組はブログ（リンク）へ
- 平田機工株式会社（宇土高校・ブログ）
- エーザイ生科研（宇土高校・ブログ）
- カネリョウ海藻株式会社（宇土高校・ブログ）
- 保健環境科学研究所（宇土高校・ブログ）
- メルシャン八代工場（宇土高校・ブログ）
- JNC(株)水俣製造所（宇土高校・ブログ）
- 熊本県水産研究センター（宇土高校・ブログ）
- 不二ライトメタル株式会社（宇土高校・ブログ）
- KMバイオロジクス株式会社（宇土高校・ブログ）
- 三菱ケミカル株式会社（宇土高校・ブログ）
海外の大学の研究者が先生です！
海外大学との高大連携：台湾・静宜大学（Providence University）との姉妹提携
台湾・台中市にある静宜大学と独自に姉妹提携（2018年１月に締結）を結んでおり，SSコースの生徒は授業料免除等の特待制度を利用して進学することができます。また，連携を充実させるため，2019年に高大連携協定（学学協定）をさらに結び，短期留学プログラム（５月頃実施）を開始しました。今後は，短期留学の中に，プログラミング講座を組み込み，静宜大学の研究室と連携するなど拡充を図る予定です。現在，短期留学プログラムには毎年参加者がおり，また，進学希望者も毎年出ています。
